双线连续五级船闸由上下游引航道、闸室主体段、输水系统、山体排水系统等建筑物组成。船闸线路总长6442米， 其中船闸主体段长1621米，单级闸室有效尺寸为280米×34米×5米。船闸主体段闸室位于花岗岩内，边坡陡高。 在中隔墩和两侧边墙岩体内共布置四条输水隧洞，条件复杂。双线连续五级船闸设计总水头113米， 单级最大水头45.2米均为世界之最。

船闸设计结构复杂，施工难度大，加上缺乏设计和施工经验，具有较高风险，是一项具有挑战性的工作。。 

新颖的船闸总体布置： 

船闸的级数和布置方式，经工程量、投资、运行管理条件以及与枢纽总布置关系等综合因素比选，
采用双线五级连续船闸，布置在左岸山体侧。为满足通航建筑物的通航水流条件；满足在水库有泥沙淤积的情况下，
船闸如何长期维持引航道的通航尺度和良好的通航水流条件；
满足船闸的建筑物及相应的设备如何适应水库运行水位分期蓄水和变幅要求；如何保证船闸冲泄水时间；
如何保证附近的升船机的通航安全等。 

船闸引航道布置及通航水流条件与泥沙淤积关系密切。通过坝区泥沙模型和水工模型试验研究，
参照葛洲坝工程船闸引航道防淤、清淤的成功经验，三峡工程船闸引航道采用综合防淤、清淤措施，
以解决引航道泥沙淤积碍航和通航水流条件问题。 

在技术设计阶段，经三峡总公司组织专家审定上游引航道隔流堤采用“全包”方案，
即长2113米的隔流堤将双线五级船闸和升船机以及将临时船闸改建的冲沙闸全部包进隔流堤内的方案。